Opetustilat tulee suunnitella sellaisten ryhmäkokojen mukaan, jotka mahdollistavat turvallisen työskentelyn. Yhden kokeellisen työskentelyn oppijapaikan tilantarve on noin 2,5 m2. Esteettömän oppijapaikan (esim. pyörätuolia käyttävälle oppijalle) tilantarve on kaksinkertainen eli noin 5 m2. Opettajan työskentelyalue ja opetustilakohtaiset varusteet tarvitsevat tilaa noin 20 m2, joten kokeellinen työskentely 16 oppijan ryhmässä edellyttää noin 65 m2:n suuruista opetustilaa, 20 oppijan ryhmässä noin 75 m2:n suuruista opetustilaa, 24 oppijan ryhmässä noin 85 m2:n suuruista opetustilaa jne.
Mikäli luonnontieteen opetustiloja tarvitaan useita, ei niiden kaikkien tarvitse olla samansuuruisia ja varustukseltaan samanlaisia. Jos esimerkiksi valinnaisryhmät ovat muita ryhmiä pienempiä, tämä otetaan huomioon tilojen kokoa suunniteltaessa. Opetustilojen lisäksi tarvitaan säilytystilaa oppimateriaalia sekä opetus- ja tutkimusvälineitä varten sekä mahdollisesti valmistelutilaa. Ensimmäistä opetustilaa kohden säilytystilaa tulee olla noin 35 m2. Tähän pinta-alaan sisältyy kemikaalikaappi/-huone. Seuraavia opetustiloja varten tulee säilytystilaa varata n. 20 m2 jokaista opetustilaa kohden. Luokkatilojen suunnittelussa voi olla tarpeen hyödyntää alan asiantuntijoita.
Osa luonnontieteen kokoelmista voidaan säilyttää vitriineissä koulun auloissa ja käytävillä, jolloin ne ovat koko ajan oppijoiden nähtävissä. Sekä maastotyöskentelyvälineiden varastointi että kasvi-/kasvatushuone vaativat kumpikin tilaa noin 20 m2.